Nước thải của trang trại bò sữa chủ yếu đến từ phân bò, nước tiểu, nước rửa chuồng bò, nước khử trùng vắt sữa và nước rửa thùng sữa, là một loại nước thải hữu cơ nồng độ cao, giàu các chất dinh dưỡng như nitơ, phốt pho, nếu xử lý không đúng cách, sẽ gây ô nhiễm môi trường nước nặng.   

 Trang trại nuôi trồng sử dụng công nghệ làm sạch phân khô, một lượng lớn phân sau khi sấy khô được vận chuyển ra ngoài làm phân bón nông nghiệp; nước thải chủ yếu đến từ nước tiểu phân bò, nước rửa vòng bò, nước thải vắt sữa.   
Đặc điểm chất lượng nước thải chăn nuôi bò:
 (1) Chất lượng nước thay đổi lớn, tải trọng tác động lớn: nước thải của trang trại bò sữa chủ yếu đến từ nước thải rửa của chuồng bò, do quá trình rửa là gián đoạn, dẫn đến sự thay đổi lớn của chất lượng nước, trong thời gian ngắn của việc rửa chuồng bò, tải trọng tác động đối với công nghệ xử lý sinh học nước thải là lớn.   
 (2) hỗn hợp chất rắn-lỏng, chất lơ lửng nhiều, nồng độ chất hữu cơ cao, khó xử lý lớn: nước thải rửa có chứa một lượng lớn phân và nước tiểu còn lại, vắt sữa khử trùng nước thải có chứa một lượng lớn chất hữu cơ, gây ra  Nồng độ chất lơ lửng và chất hữu cơ cao trong nước thải.  

 (3) hàm lượng amoniac-nitơ cao, tỷ lệ carbon-nitơ mất cân bằng: nước thải của trang trại nuôi bò sữa chủ yếu bao gồm phân bò, nước tiểu bò và các chất có hàm lượng nitơ-nitơ cao, vì vậy nồng độ amoniac-nitơ trong nước thải tương đối cao, tỷ lệ carbon-nitơ dễ mất cân bằng.  

 Xử lý nước thải nuôi trồng thường được chia thành xử lý trước, lên men kỵ khí, xử lý thiếu oxy và kỵ khí, lắng đọng hóa học, xử lý sâu 5 quy trình I, tùy theo điều kiện môi trường xung quanh các trang trại nuôi bò và tiêu chuẩn phát thải do bộ phận bảo vệ môi trường đưa ra, chọn một phần hoặc toàn bộ quy trình, dưới đây sẽ giới thiệu riêng 5 quy trình xử lý này.    
1) Xử lý trước
  Xử lý trước chủ yếu là tách rắn-lỏng, do nước thải chứa một lượng lớn phân và thức ăn, chất lơ lửng trong nước thải rất cao, và những chất lơ lửng này đều là thành phần hữu cơ, có thể được sử dụng như phân bón, có giá trị kinh tế nhất định, có thể thông qua cách tách rắn-lỏng sẽ lơ lửng từ nước thải tách ra, vừa làm giảm áp lực xử lý nước thải sau đó, nhưng cũng có lợi ích kinh tế.  
 Tất nhiên, cũng có một số không tách chất rắn-lỏng, tất cả phân đều được lên men kỵ khí và khí sinh học được sản xuất để phát điện, ngoài việc đáp ứng nhu cầu của trang trại nuôi trồng, nó cũng có thể được bán ra ngoài mạng lưới, cũng có thể tạo ra một số lợi ích kinh tế.   Tuy nhiên, độ khó xử lý nước thải và đầu tư kỹ thuật sẽ tăng lên đáng kể.
2) Kỵ khí lên men
  Mục đích của quá trình lên men kỵ khí chủ yếu là loại bỏ các chất hữu cơ trong nước thải, khoảng 80% chất hữu cơ có thể được loại bỏ trong quá trình này, quá trình lên men kỵ khí chủ yếu là UASB, USR (bể lên men khí sinh học), bể khí sinh học màng đen.   
3) Thiếu oxy - xử lý aerobic
  Do amoniac-nitơ trong nước thải của trang trại chăn nuôi bò rất cao, hiệu quả loại bỏ của quá trình hiếu khí thông thường là hạn chế, nên phải sử dụng quá trình kết hợp thiếu oxy và hiếu khí để loại bỏ nitơ trong nước thải.  
4) Chất kết tủa hóa học
  Ngoài chất hữu cơ và amoniac nitơ bên ngoài trong nước thải của trang trại chăn nuôi bò, hàm lượng phốt pho cũng tương đối cao, xử lý sinh hóa thông thường I trình tự rất khó đạt tiêu chuẩn, do đó phải hóa chất phốt pho thuốc, mới có thể đảm bảo phốt pho đạt tiêu chuẩn.  
5) xử lý sâu  Xử lý sâu nói chung là ao oxy hóa sinh học hoặc vùng ngập nước nhân tạo, trong đó hiệu quả của vùng ngập nước nhân tạo tốt hơn, nhưng đầu tư cũng cao hơn nhiều, nếu muốn đạt tiêu chuẩn xả nước thải tổng hợp, đề nghị sử dụng vùng ngập nước nhân tạo, nếu chỉ đạt tiêu chuẩn xả nước thải ngành nghề nuôi trồng, sử dụng ao oxy hóa sinh học là được, có thể tiết kiệm được rất nhiều đầu tư.